Hallo Flo,
viel bleibt da wirklich nicht!
Sitzposition scheidet wahrscheinlich aus, da der Instruktor sie als richtig bewertet und wenn sie völlig Nonsens wäre, hättest du nach 15 Minuten schon Beschwerden und nicht nach 2 Wochen.
Clicks an den Schuhe ist eine wahrscheinliche Variante, wenn du die Probleme hast, nachdem du Schuhe gekauft hast,
prüfe mal nach, ob du den Schuh(Fuß) sehr nach aussen oder innen verkanntest.
Krafttraining ist sicherlich sinnvoll, gerade Bauch und noch wichtiger Rücken sollten gestärkt werden, scheiden aber als Ursache aus.
Vielleicht noch ne Idee, wie sieht es mit den Bändern in Knie aus. Bei mir ist es so, daß ich nicht mehr lange knien oder in der Hocke bleiben kann, bzw bei durchstrecken der Beine überdehne ich im Gelenk. Solltest du vielleicht mal überprüfen lassen, bzw mit deinem Doc besprechen.
Interessant ist vielleicht auch mal zu schauen, wann es auftritt, also hohe Trittfrequenzen, oder eher bei hohem Widerstand.
Ansonsten Freedom To Ride, du bestimmst deine Intensität!
Andreas